More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0211 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.13 
 
 
233 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7134  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.36 
 
 
233 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.88 
 
 
233 aa  279  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4758  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.95 
 
 
229 aa  279  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000972291  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.01 
 
 
233 aa  276  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  0.589272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.01 
 
 
233 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0675753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.72 
 
 
236 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.91 
 
 
234 aa  271  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.623849  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.79 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.286182  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.39 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.406883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.39 
 
 
231 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0192  putative short chain dehydrogenase  43.04 
 
 
242 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01430  putative short chain dehydrogenase  42.62 
 
 
242 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
242 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100527  hitchhiker  0.00000000000000573842 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6063  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
244 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
242 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 
244 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0912876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
245 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
298 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
270 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
243 aa  158  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
246 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5150  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
245 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.855408  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6052  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
244 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
246 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
233 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
245 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
246 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
242 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.73156 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
247 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
243 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
236 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
243 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.997812  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3907  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
242 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
243 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0125  putative short-chain dehydrogenase  42.53 
 
 
251 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167282  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
245 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
243 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.959841  normal  0.948307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
243 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.477245  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1429  putative short chain dehydrogenase  40.72 
 
 
255 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0142778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0314  putative acetoin(diacetyl) reductase  37.6 
 
 
245 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0714  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
258 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0749  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
258 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.66118  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2436  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
292 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1166  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
253 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1712  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
258 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.595621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1240  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
246 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.495414  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1562  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.64 
 
 
278 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  134  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0908  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.11 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700496  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.325516  hitchhiker  0.000000000000965184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02694  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G14000)  36.84 
 
 
243 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
251 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03293  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
264 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00545103 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20677  predicted protein  35.74 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732911  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00930  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 
252 aa  95.5  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0806926  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.64 
 
 
258 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
261 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.901767  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  33.52 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.31 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.26 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  34.08 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.26 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  30 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.46 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.22 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  31.55 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  31.72 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
228 aa  82  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.61 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.61 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>