More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1613 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  50.13 
 
 		 796 aa  699    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  100 
 
 		 765 aa  1551    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  47.06 
 
 		 767 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  40.39 
 
 		 791 aa  468  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  40.21 
 
 		 720 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  40 
 
 		 709 aa  439  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  38.83 
 
 		 717 aa  428  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  44.76 
 
 		 386 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  45.19 
 
 		 379 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  44.5 
 
 		 386 aa  349  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  46.13 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  45.14 
 
 		 372 aa  324  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  33.2 
 
 		 675 aa  307  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  28.02 
 
 		 726 aa  294  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  45.09 
 
 		 402 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  27.76 
 
 		 726 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  31.7 
 
 		 730 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  31.97 
 
 		 675 aa  273  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  27.55 
 
 		 727 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  44.44 
 
 		 369 aa  260  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 		 366 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  25.88 
 
 		 722 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.33 
 
 		 374 aa  231  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  25.52 
 
 		 723 aa  214  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  35.89 
 
 		 342 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  25.55 
 
 		 723 aa  210  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  25.77 
 
 		 723 aa  210  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  39.67 
 
 		 316 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  36.81 
 
 		 347 aa  209  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.48 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  36.89 
 
 		 351 aa  197  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 		 381 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  35.74 
 
 		 348 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  39.17 
 
 		 343 aa  194  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  36.83 
 
 		 320 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.39 
 
 		 374 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  39.8 
 
 		 318 aa  188  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  33.33 
 
 		 343 aa  187  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  33.03 
 
 		 343 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  35.98 
 
 		 354 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  39.35 
 
 		 327 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  34.54 
 
 		 309 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  37.87 
 
 		 350 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  33.96 
 
 		 354 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  34.19 
 
 		 323 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  38.32 
 
 		 351 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  35.58 
 
 		 328 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  32.7 
 
 		 340 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 		 366 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  35.48 
 
 		 315 aa  180  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  34.69 
 
 		 337 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  37.38 
 
 		 317 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  34.84 
 
 		 325 aa  179  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  33.63 
 
 		 347 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  39.04 
 
 		 340 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  38.79 
 
 		 355 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  39.48 
 
 		 314 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  33.86 
 
 		 352 aa  174  5.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  37.54 
 
 		 316 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  34.19 
 
 		 344 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  37.72 
 
 		 345 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  35.06 
 
 		 321 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  34.78 
 
 		 328 aa  172  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  34.83 
 
 		 356 aa  171  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  32.85 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  31.76 
 
 		 343 aa  169  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  34.53 
 
 		 356 aa  169  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  36.42 
 
 		 346 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  36.48 
 
 		 321 aa  168  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  36.75 
 
 		 291 aa  168  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  34.62 
 
 		 671 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  36.04 
 
 		 389 aa  167  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  34.81 
 
 		 347 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  35.39 
 
 		 314 aa  167  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  37.19 
 
 		 328 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  33.96 
 
 		 351 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  34.35 
 
 		 326 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  32.66 
 
 		 343 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  37.21 
 
 		 357 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  35.83 
 
 		 333 aa  165  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  32.26 
 
 		 344 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  32.08 
 
 		 358 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  32.72 
 
 		 380 aa  164  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  34.72 
 
 		 355 aa  163  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  33.23 
 
 		 350 aa  163  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  35.67 
 
 		 352 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  33.53 
 
 		 357 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  32.39 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  31.69 
 
 		 359 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  34.74 
 
 		 358 aa  162  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  34.45 
 
 		 346 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  34.75 
 
 		 317 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  33.84 
 
 		 348 aa  161  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  34.32 
 
 		 356 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  34.32 
 
 		 385 aa  160  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  35.44 
 
 		 346 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  34.32 
 
 		 421 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  31.64 
 
 		 353 aa  160  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  32.96 
 
 		 357 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>