50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1154 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 182 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  39.87 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  37.41 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  34.46 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  23.48 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  26.09 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  25.24 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  25.24 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  23.81 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  24.09 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 158 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.09 
 
 		 146 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  23.68 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  23.81 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>