More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0699 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  67.11 
 
 		 530 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  74.63 
 
 		 553 aa  818    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 545 aa  1108    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  60.67 
 
 		 538 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  59.81 
 
 		 533 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  61.73 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  57.6 
 
 		 532 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  52.8 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  54.27 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  55.41 
 
 		 529 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  52.36 
 
 		 539 aa  505  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  50.94 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  52.17 
 
 		 538 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 608 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  51.98 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  48.88 
 
 		 522 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  48.45 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  48.26 
 
 		 522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  48.7 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  48.7 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  48.7 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  48.7 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  46.25 
 
 		 524 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  46.43 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  46.98 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 		 538 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  42.62 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 		 505 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  44.72 
 
 		 509 aa  350  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  43.35 
 
 		 505 aa  350  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 		 505 aa  343  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 514 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  45.02 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 519 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 		 523 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 529 aa  293  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 		 522 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 521 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 527 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 526 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 		 514 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 520 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 516 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 499 aa  223  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  31.93 
 
 		 534 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 546 aa  220  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.55 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  31.68 
 
 		 534 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 770 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3059  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000983491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.06 
 
 		 510 aa  207  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.16 
 
 		 510 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 513 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.16 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 510 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  29.01 
 
 		 541 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 523 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 662 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 495 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 553 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 418 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 509 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 545 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 530 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.19 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  28.15 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>