More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0311 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
281 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  88.6 
 
 
285 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 
286 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  59.79 
 
 
279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  42.05 
 
 
277 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  44.79 
 
 
298 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 
278 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 
285 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  43.55 
 
 
298 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 
284 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
285 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  39.16 
 
 
322 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
284 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  39.21 
 
 
286 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.35 
 
 
285 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
314 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
287 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 
287 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
278 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  33.11 
 
 
286 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.59 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
331 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.47 
 
 
277 aa  105  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
266 aa  92  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.84 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.84 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.24 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  26.99 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.19 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  26.67 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  25.99 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.6 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  25.65 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.6 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  25.28 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  24.27 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  24.27 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  26.3 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.61 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  27.64 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.8 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  26.55 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.2 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  25 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  25.52 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 
425 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.06 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>