218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6210 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
402 aa  828    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  41.54 
 
 
424 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.16 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.33 
 
 
357 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  26.51 
 
 
385 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.16 
 
 
383 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  24.59 
 
 
386 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  27.51 
 
 
403 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.57 
 
 
388 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  24.47 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  23.56 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  24.41 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  31.33 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  30.66 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.45 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.58 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  25.68 
 
 
401 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  26.13 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  32.85 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  24.38 
 
 
390 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  28.51 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.94 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.39 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  26.49 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  23.68 
 
 
386 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.54 
 
 
463 aa  86.3  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  29.26 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.87 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.56 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.21 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.39 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  23.1 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.21 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  23.1 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  27.14 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  32.58 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  23.81 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  26.19 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  23 
 
 
402 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  23 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.47 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.36 
 
 
656 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  24.55 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.66 
 
 
258 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  34.23 
 
 
256 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  23.45 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  30.95 
 
 
345 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  30.41 
 
 
467 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  23.45 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  23.45 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  23.36 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  31.93 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  34.58 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  35.34 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  28.37 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  25.27 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  25.1 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  25.9 
 
 
325 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.63 
 
 
596 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.87 
 
 
259 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  30.63 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  25.79 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  25.81 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  26.42 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  25.71 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.71 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  30.09 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  25.71 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  23.27 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  25.71 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  25.71 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  27.45 
 
 
406 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.38 
 
 
691 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  22.51 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 
665 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  30.95 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  24.46 
 
 
253 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  30.84 
 
 
330 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  29.32 
 
 
337 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  26.47 
 
 
415 aa  53.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  29.66 
 
 
342 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  33.01 
 
 
307 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  24.27 
 
 
416 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  32.28 
 
 
354 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.62 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.62 
 
 
642 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  29.85 
 
 
305 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  28.24 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  22.67 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  29.84 
 
 
414 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  28.81 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  28.36 
 
 
305 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  25.31 
 
 
414 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  29.75 
 
 
414 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.97 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>