More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5953 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  100 
 
 		 343 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  65.22 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  64.03 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  65.02 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  63.46 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  66.22 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  64.98 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  59.87 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  64.14 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  63.73 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  65.35 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  63.73 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  61.74 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.74 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3988  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  64.43 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1605  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  64.43 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3373  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  64.43 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  64.43 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  64.43 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  64.43 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  58.81 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3327  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.42 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2463  inner-membrane translocator  62.87 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  63.76 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3117  inner-membrane translocator  62.54 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.848648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  60.13 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  61.76 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 333 aa  358  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  57.01 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  55.52 
 
 		 314 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  59.32 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  58.28 
 
 		 323 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0087  inner-membrane translocator  60.67 
 
 		 324 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0105  inner-membrane translocator  62.21 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2968  inner-membrane translocator  62.21 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0087  inner-membrane translocator  62.21 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410791  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  58.42 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3758  putative branched-chain amino acid transport permease  60.51 
 
 		 327 aa  339  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4077  inner-membrane translocator  63.07 
 
 		 335 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.41 
 
 		 331 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  55.14 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 314 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  55.95 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  54.97 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  56.77 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  57.53 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  56.71 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  56.95 
 
 		 329 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  54.75 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  55.91 
 
 		 332 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  56.77 
 
 		 329 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  54.75 
 
 		 313 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  50 
 
 		 323 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  57.62 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  49.19 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  48.54 
 
 		 323 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  48.87 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.34 
 
 		 656 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  56.58 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  56.58 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  47.88 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  56.38 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1676  inner-membrane translocator  48.54 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  49.53 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.49 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  37 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  34.69 
 
 		 594 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  37.67 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  38.61 
 
 		 621 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 402 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.21 
 
 		 838 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  37.75 
 
 		 842 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.33 
 
 		 632 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  34.44 
 
 		 597 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>