More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5848 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  100 
 
 
365 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  81.5 
 
 
355 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0343  LacI family transcription regulator  54.19 
 
 
338 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0241073  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4738  alanine racemase  55.13 
 
 
351 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0927  LacI family transcription regulator  51.69 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  48.66 
 
 
343 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  47.02 
 
 
342 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  45.07 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2785  transcriptional regulator of LacI family protein  32.65 
 
 
350 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544473  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 
335 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  38.95 
 
 
350 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.15 
 
 
334 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.83 
 
 
336 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  38.39 
 
 
365 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  35.16 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 
342 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 
337 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 
347 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  36.26 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.62 
 
 
338 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 
356 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 
333 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 
354 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
356 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.09 
 
 
339 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 
335 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 
352 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.21 
 
 
334 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.33 
 
 
339 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0696  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 
357 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.477401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 
338 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 
337 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0746  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
360 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 
340 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 
336 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.84 
 
 
336 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.72 
 
 
333 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.24 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0802  alanine racemase  35.78 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2112  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  30.12 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.01 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  30.65 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.64 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  28.31 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1882  LacI family transcriptional regulator  33.53 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.711539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  30.24 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  32.83 
 
 
343 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.72 
 
 
334 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 
344 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3343  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
349 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716413  normal  0.0750883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 
338 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.47 
 
 
342 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 
337 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.47 
 
 
342 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
340 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  30.95 
 
 
343 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 
347 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 
343 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 
349 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.31 
 
 
376 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 
346 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 
358 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.53 
 
 
340 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 
357 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 
343 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  34.18 
 
 
361 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27370  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 
339 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316556  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 
339 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 
340 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  30 
 
 
323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
343 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
343 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
340 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 
332 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  30 
 
 
323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
343 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  29.43 
 
 
331 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.84 
 
 
342 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  30.65 
 
 
343 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.34 
 
 
341 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.4 
 
 
337 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  30.97 
 
 
343 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1131  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
332 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  30.36 
 
 
343 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  27.99 
 
 
341 aa  159  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1875  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.2 
 
 
331 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398277  normal  0.10708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>