More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5283 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
273 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
260 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
260 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
263 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  46.75 
 
 
264 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
268 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
258 aa  191  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
282 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  43.9 
 
 
268 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
289 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
250 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
258 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.13 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 
268 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
258 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
261 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
258 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
263 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
262 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
267 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 
257 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 
257 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
268 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
261 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2484  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
257 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.585223  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
263 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  31.74 
 
 
257 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  31.74 
 
 
257 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
287 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
273 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
259 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
270 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
259 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.41 
 
 
257 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
258 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  33.65 
 
 
266 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
257 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
259 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
258 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 
258 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.58 
 
 
262 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
258 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
260 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
258 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 
267 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
257 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  33.33 
 
 
272 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
257 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 
258 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
266 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
277 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
259 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
256 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
259 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
262 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
259 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.91 
 
 
258 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.33 
 
 
266 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
258 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
261 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
258 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
269 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
269 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
269 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
262 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
257 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.3 
 
 
260 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
269 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 
259 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  29.36 
 
 
260 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.3 
 
 
260 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2128  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 
259 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00663938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.64 
 
 
256 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  27.69 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
251 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
256 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  30.89 
 
 
258 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
261 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
268 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>