More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0010 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0010  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  556  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0859138 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0008  enoyl-CoA hydratase  77.99 
 
 
268 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48200  enoyl-CoA hydratase  51.72 
 
 
265 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000881528  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5490  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 
268 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  50.95 
 
 
263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2314  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
263 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.07 
 
 
264 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.461474  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2844  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
259 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3988  enoyl-CoA hydratase  47.27 
 
 
263 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0959  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
262 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.189039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4945  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
271 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1197  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
271 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6177  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
262 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00572297  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.59 
 
 
152 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.07 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
258 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 
260 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
257 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
271 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
263 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.01 
 
 
258 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  29.02 
 
 
258 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
271 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
269 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.37 
 
 
256 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
269 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
266 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 
269 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
259 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.89 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
264 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.27 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.89 
 
 
255 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
259 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.68 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 
287 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  30.47 
 
 
253 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.5 
 
 
255 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.99 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  28.78 
 
 
275 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 
257 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
247 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
247 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
247 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
265 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
258 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.17 
 
 
297 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
261 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
262 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  32.17 
 
 
297 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.17 
 
 
261 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.78 
 
 
297 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
259 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  32.17 
 
 
261 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  32.17 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.92 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 
257 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>