More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4941 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  100 
 
 		 799 aa  1571    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 		 819 aa  778    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 777 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 777 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.47 
 
 		 784 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  35.83 
 
 		 759 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 757 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 795 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 795 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 795 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 828 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 795 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 795 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 797 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  35.36 
 
 		 797 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  36.85 
 
 		 766 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  34.64 
 
 		 795 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  36.95 
 
 		 751 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 829 aa  353  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 754 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  36.24 
 
 		 789 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 785 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 513 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 737 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 377 aa  157  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  32.71 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 377 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 377 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 363 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 377 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 		 364 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 365 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 		 364 aa  145  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 365 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 364 aa  145  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 365 aa  145  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 363 aa  145  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 365 aa  145  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  34.4 
 
 		 364 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 944 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 645 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 828 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1207 aa  134  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 854 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 581 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 682 aa  128  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 453 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 610 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  25.81 
 
 		 799 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 625 aa  124  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 589 aa  123  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 827 aa  123  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 953 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 489 aa  122  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  28.72 
 
 		 553 aa  121  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 793 aa  121  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 755 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  26.24 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 408 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  34.16 
 
 		 549 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  35.87 
 
 		 639 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  34.19 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1014 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 754 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 556 aa  119  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 737 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  30.35 
 
 		 551 aa  117  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 839 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710267  hitchhiker  0.00000913845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 1046 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.73 
 
 		 470 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  34.78 
 
 		 535 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 933 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  30.85 
 
 		 407 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 758 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 634 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  27.68 
 
 		 424 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.17 
 
 		 599 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  27.72 
 
 		 340 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 799 aa  115  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 458 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4551  histidine kinase  33.8 
 
 		 480 aa  114  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 609 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 899 aa  114  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 456 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 615 aa  114  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.53 
 
 		 587 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 899 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.53 
 
 		 587 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>