More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3512 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  100 
 
 		 390 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  72.21 
 
 		 403 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  69.85 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  70.91 
 
 		 402 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  70.65 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  66.41 
 
 		 385 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  66.4 
 
 		 390 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  64.6 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  64.34 
 
 		 383 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  60.62 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  59.38 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  59.38 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  59.84 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  59.15 
 
 		 381 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  56.62 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  52.06 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  50.53 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  49.61 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  46.7 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  47.23 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  50.92 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  44.27 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  43.19 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  43.42 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 		 388 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  41.84 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  42.63 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  43.01 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  42.11 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  41.71 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.82 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  40.46 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.56 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  40.67 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.36 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  41.73 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  41.24 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  42.15 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  43.86 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  40.67 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.58 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  40.89 
 
 		 387 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  39.64 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  40.77 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  39.85 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.58 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  41.51 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.92 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  38.08 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  37.97 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.31 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  35.29 
 
 		 406 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  35.83 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.24 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.67 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  36.15 
 
 		 390 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  37.89 
 
 		 453 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.19 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.95 
 
 		 387 aa  209  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  34.2 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.52 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  37.44 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  36.87 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.26 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.24 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  39.18 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  39.18 
 
 		 550 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  39.18 
 
 		 550 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  37.87 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  35.37 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.35 
 
 		 397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.63 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.41 
 
 		 548 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.32 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  35.01 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.14 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.92 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.73 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.15 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.02 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  35.01 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  37.4 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.41 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.78 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.78 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.06 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.08 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  34.75 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.97 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.41 
 
 		 402 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.41 
 
 		 402 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  35.47 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>