More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1918 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  45.42 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  44.38 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  45.79 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  44.11 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.47 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.47 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  42.28 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.63 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.33 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  38.36 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  39.64 
 
 		 333 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.96 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.8 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.07 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.27 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.48 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  41.59 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.14 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  41.27 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.69 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  42.28 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.21 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.92 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.67 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.06 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.06 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.06 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.42 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.68 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.94 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  37.61 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  37.18 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.14 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.07 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  37.89 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  35.6 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.97 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.17 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  37.1 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.27 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.16 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.58 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.51 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.41 
 
 		 356 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  37.77 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.5 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.26 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  38.89 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.58 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.07 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  38.58 
 
 		 333 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.66 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  35.71 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  41.33 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.29 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40.74 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.6 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  40.6 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  40.8 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.05 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.42 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  37.13 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.2 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.7 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  38.76 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  39.61 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.85 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.23 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.78 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.85 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  39.25 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.54 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.76 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.19 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.13 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>