45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3681 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
243 aa  477  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  74.15 
 
 
244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  46.56 
 
 
248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  50.22 
 
 
238 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  51.57 
 
 
384 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  63.01 
 
 
375 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  33.51 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  36.24 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  33.85 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  34.94 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  30.22 
 
 
308 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  31.21 
 
 
298 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  37.12 
 
 
188 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.94 
 
 
302 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  35 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  35.48 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  40.91 
 
 
1281 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  37.11 
 
 
368 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  35.15 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  38.38 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  29.17 
 
 
354 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  31.85 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  27.95 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  29.27 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 
846 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  34.65 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  32.43 
 
 
267 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  37.86 
 
 
178 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  33.06 
 
 
223 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  32.8 
 
 
214 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  34.52 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  27.33 
 
 
350 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  32.58 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  35.71 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  34.82 
 
 
279 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  36.36 
 
 
916 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  30.86 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.93 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  35.29 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  32.03 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  32.69 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  29.51 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  55.26 
 
 
773 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  30.77 
 
 
167 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  32 
 
 
215 aa  42.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>