93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3592 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  90.31 
 
 		 354 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  100 
 
 		 354 aa  719    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  24.83 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  28.62 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  29.28 
 
 		 350 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.29 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  28.05 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  25.59 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  23.65 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.29 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  28.76 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  25.52 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  26.07 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  26.07 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  29.19 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  26.74 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  28.17 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  26.39 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  26.83 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  26.9 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  26.47 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  24.82 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  23.16 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  29.12 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  24.3 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  25.42 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  26.47 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  27.8 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  25.33 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  30.6 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  27.41 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  28.44 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  26.13 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  30.38 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  34.38 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  28.1 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  26.34 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  30.11 
 
 		 384 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  34.41 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  25 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  30.1 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  25 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  30.09 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  27.5 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  31.18 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.6 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  30.11 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  28.38 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  24.19 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  40.62 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.73 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  27.38 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  40.58 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  30.81 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  32.95 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  23.33 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  36.25 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  40.58 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  27.37 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  37.14 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  35.82 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  28.57 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  25.63 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  24.42 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  22.58 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  27.54 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.05 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  24.14 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  29.36 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  25 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  33.65 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.39 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  26.36 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  24.28 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  30.68 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.14 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  24.56 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  32.39 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  23.69 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  27.82 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  21.52 
 
 		 386 aa  42.7  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  27.96 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  35.96 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  35.71 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  35.71 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  35.71 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  35.71 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>