More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2668 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 322 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  87.58 
 
 		 322 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  51.48 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  41.22 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.23 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.07 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.44 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.12 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0492  Monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302976  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.66 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.73 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.68 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 835 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.68 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.37 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  32.89 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  31.37 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.06 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.6 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.9 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.84 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  29.69 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.76 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1465  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.168191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.09 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  31.31 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.76 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.58 
 
 		 358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 849 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.55 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.58 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.8 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1460  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  31.64 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  31.64 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  29.93 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.93 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>