89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3436 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1368    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  41.03 
 
 		 682 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  32.58 
 
 		 860 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  29.92 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  29.17 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  27.78 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  25.42 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  28.8 
 
 		 773 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  26.47 
 
 		 738 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  38.14 
 
 		 587 aa  55.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69965  Heat shock protein 90 homolog  28.85 
 
 		 709 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0615348  normal  0.460781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  25.74 
 
 		 671 aa  54.7  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  27.56 
 
 		 673 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  29.5 
 
 		 626 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  28 
 
 		 679 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  30 
 
 		 677 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  27.69 
 
 		 662 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  27.27 
 
 		 651 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  30 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  30.65 
 
 		 723 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  29.55 
 
 		 598 aa  51.2  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0286  hypothetical protein  30.71 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  32.52 
 
 		 621 aa  50.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  28.06 
 
 		 631 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  27.74 
 
 		 702 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  27.59 
 
 		 643 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  31.2 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  24.85 
 
 		 642 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  30.22 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  30.7 
 
 		 698 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  27.27 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  25.23 
 
 		 657 aa  48.9  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26010  TRAP1, Heat Shock Protein 90  27.82 
 
 		 700 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0886232  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01520  chaperone, putative  30.71 
 
 		 700 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.724497  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  27.34 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  43.75 
 
 		 585 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  26.72 
 
 		 838 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  28.28 
 
 		 640 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.58 
 
 		 589 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  29.08 
 
 		 629 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  27.22 
 
 		 627 aa  48.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  29.88 
 
 		 633 aa  47.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  33.33 
 
 		 722 aa  47.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  30.16 
 
 		 624 aa  47.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  27.33 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  28.37 
 
 		 637 aa  47.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  31.34 
 
 		 640 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  31.21 
 
 		 613 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  26.24 
 
 		 643 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  25.75 
 
 		 945 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  28.06 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  26.76 
 
 		 638 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  27.61 
 
 		 629 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  28.37 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  29.5 
 
 		 636 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  41.27 
 
 		 644 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1408  DNA mismatch repair protein MutL  39.13 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  27.78 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0401  heat shock protein 90  27.34 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  28.99 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  23.79 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0570  heat shock protein 90  27.61 
 
 		 616 aa  45.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  30.37 
 
 		 780 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  28.78 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  23.79 
 
 		 629 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  27.27 
 
 		 644 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  46 
 
 		 621 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 652 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  32.18 
 
 		 695 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  31.75 
 
 		 987 aa  45.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  29.84 
 
 		 643 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  25 
 
 		 636 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  30.91 
 
 		 730 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 603 aa  44.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  24.2 
 
 		 630 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  27.44 
 
 		 628 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  23.5 
 
 		 630 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  26.23 
 
 		 622 aa  44.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  37.68 
 
 		 767 aa  44.3  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  28.36 
 
 		 585 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  37.7 
 
 		 590 aa  44.3  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  38.1 
 
 		 608 aa  43.9  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  33.33 
 
 		 774 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  25.65 
 
 		 946 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 		 705 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  26.95 
 
 		 635 aa  43.9  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  24.63 
 
 		 650 aa  43.9  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0466  heat shock protein 90  24.63 
 
 		 650 aa  43.9  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>