More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1960 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  83.62 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  83.62 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  69.17 
 
 		 121 aa  170  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  65.81 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  68.57 
 
 		 330 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.31 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 113 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  54.72 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  58.51 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  53.64 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  49.11 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  50.93 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  54.64 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  51.96 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 146 aa  105  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  48.65 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  50.47 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  51.02 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  45.19 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  47.17 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  46.67 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  41.82 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  44.14 
 
 		 112 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  47.12 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.15 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  48.04 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  48.39 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  44 
 
 		 113 aa  87  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  44.33 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  44.86 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  39.09 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  40.17 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  41.12 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  45.12 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  43 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  45.68 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  38.68 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  38.53 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  36.11 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  43.68 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0985  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>