181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0880 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  100 
 
 		 353 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  98.58 
 
 		 353 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  93.2 
 
 		 353 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  59.2 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 352 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  55.69 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  52.8 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  36.36 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.89 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.57 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.63 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  25.63 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.66 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.34 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  25.07 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.34 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.34 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.53 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.34 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  24.51 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.39 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.07 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.07 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  24.79 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  24.79 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.01 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  29.86 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  36.72 
 
 		 1033 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.78 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.23 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.05 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  24.18 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.18 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  24.18 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  24.18 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.78 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.4 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.46 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  35.43 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  31.01 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.55 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.83 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.21 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  32.43 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  32.67 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  29.92 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.82 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  27.4 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  32.67 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.94 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  24.04 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.93 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.77 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  32.17 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  24.11 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  28 
 
 		 398 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.95 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  26.02 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.55 
 
 		 666 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.53 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.81 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  24.77 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  33.03 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 380 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  27.43 
 
 		 652 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>