78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4397 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0942  hypothetical protein  52.36 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4222  tetratricopeptide TPR_2  60.18 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.22 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  56.54 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37 
 
 		 988 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.69 
 
 		 1022 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 392 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.36 
 
 		 746 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.04 
 
 		 784 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  32.05 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.87 
 
 		 706 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 		 1056 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.56 
 
 		 818 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.27 
 
 		 706 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  26.19 
 
 		 541 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34 
 
 		 1056 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 707 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 649 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.5 
 
 		 582 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  38.2 
 
 		 497 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.95 
 
 		 463 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  41.38 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 421 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  37.8 
 
 		 339 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  28.87 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 628 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  34.69 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  40.24 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.45 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0407  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 423 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  34.51 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  30.67 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.27 
 
 		 820 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1421 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  43.33 
 
 		 923 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  43.18 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  25.6 
 
 		 581 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 341 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.33 
 
 		 385 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 375 aa  42.7  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  32.14 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 750 aa  42.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  34.31 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 202 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 562 aa  42  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 361 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 		 289 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 556 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  43.1 
 
 		 342 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  34.94 
 
 		 132 aa  42  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 319 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>