More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2251 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  56.69 
 
 		 136 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  55.91 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  55.91 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  50.78 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  44.88 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  41.86 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  36.13 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  30.51 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.82 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  29.84 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  30.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  29.82 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 261 aa  54.3  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  30.51 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  30.16 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  30.4 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.24 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.24 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.24 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  31.15 
 
 		 272 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  31.2 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  29.6 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  30.16 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  29.91 
 
 		 260 aa  51.6  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  30.65 
 
 		 257 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  38.36 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  27.59 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  32.61 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  29.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  30.4 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  30.4 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  47.69 
 
 		 473 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 286 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  35.05 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  28.46 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1329  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 195 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1616  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  29.46 
 
 		 352 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  30.63 
 
 		 255 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>