More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1416 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  80.1 
 
 		 206 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  78.68 
 
 		 207 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  76.53 
 
 		 207 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  75.62 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  76.02 
 
 		 204 aa  320  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  75.9 
 
 		 202 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  64.06 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  64.06 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  64.06 
 
 		 210 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  62.89 
 
 		 202 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  63.92 
 
 		 203 aa  254  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  63.92 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  60.94 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  60.85 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  57.67 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  53.65 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  55.9 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  55.85 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  56.99 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  52.63 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  54.79 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  53.65 
 
 		 192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3032  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0214  peptidyl-tRNA hydrolase  55.68 
 
 		 248 aa  203  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  57.32 
 
 		 235 aa  201  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  51.87 
 
 		 189 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 		 193 aa  201  8e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  52.36 
 
 		 191 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1630  peptidyl-tRNA hydrolase  52.85 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.144518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3190  peptidyl-tRNA hydrolase  50.79 
 
 		 234 aa  197  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29139  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1536  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1485  peptidyl-tRNA hydrolase  50.52 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3747  peptidyl-tRNA hydrolase  53.01 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3592  peptidyl-tRNA hydrolase  56.22 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0666  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 208 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0756  peptidyl-tRNA hydrolase  47.54 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.348899 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.6 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 		 198 aa  147  9e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  44.57 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  37.7 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  49.35 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.8 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  42.39 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  41.72 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.56 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  45.09 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  43.93 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.08 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.1 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.51 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0123  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.391018  normal  0.213165 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  36.67 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  45.98 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  45.98 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 		 230 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  44.89 
 
 		 188 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.24 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  43.82 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  44.89 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.51 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0529  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.52 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  35.59 
 
 		 365 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 		 193 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>