59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0338 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  70.7 
 
 		 171 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  68.12 
 
 		 171 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  61.82 
 
 		 176 aa  217  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  63.98 
 
 		 174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  62.2 
 
 		 174 aa  210  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  66.46 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  51.59 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  45.7 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  52.23 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  45.39 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  44.74 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  46.45 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  42.11 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  41.88 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  41.88 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  41.45 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  43.33 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  40 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  45.27 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.33 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  38.26 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  39.33 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  34.39 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  29.73 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  33.78 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  32.65 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  36.76 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  36.76 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  36.76 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  36.76 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  36.76 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  36.76 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  36.76 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  36.76 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  32.65 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  34.53 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  34.53 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  33.12 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  33.12 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  33.12 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  33.81 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  33.09 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  31.82 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  33.08 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  27.56 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  26.32 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  33.08 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  31.72 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  25.95 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  31.72 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  25.64 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  30.52 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  23.57 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>