21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04018 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0309  hypothetical protein  61.39 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443313  normal  0.0752906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  30.18 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  29.66 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  34.93 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  31.13 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  28.97 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  31.72 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  29.61 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  31.72 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  32.19 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  28.93 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.53 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  27.52 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  29.01 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  26.71 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  28.19 
 
 		 182 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  29.14 
 
 		 161 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  26.83 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  37.93 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  31.13 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>