26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1939 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  326  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  50.29 
 
 		 173 aa  154  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  51.23 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  43.95 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  48.86 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  47.73 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  37.34 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  34.9 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  31.07 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  28.39 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  26.35 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  26.99 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  27.63 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  28.93 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.45 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  30.52 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.18 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  28.48 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  28 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  26.79 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  23.31 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  24.46 
 
 		 164 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  22.22 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  25.53 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>