55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0438 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  86.23 
 
 		 171 aa  291  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  75.74 
 
 		 171 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  70.7 
 
 		 166 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  62.57 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  61.4 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  62.11 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  48.12 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  41.88 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  41.88 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  43.12 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  40 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  48.75 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  43.95 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  40.88 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  41.14 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  40.61 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  41.77 
 
 		 204 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  38.36 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.04 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  35.19 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  26.25 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  28.95 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  28.97 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  28.95 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  28.86 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  28.29 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  31.54 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  30.87 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  30.87 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  30.87 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  29.53 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  28.19 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  29.53 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  29.33 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  29.53 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  29.53 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  29.17 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  34.43 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  28.77 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  32.19 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  31.93 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  24.67 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>