35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3844 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  72.79 
 
 		 164 aa  230  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  73.47 
 
 		 164 aa  206  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  63.01 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  56.85 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  55.24 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  54.55 
 
 		 204 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  54.93 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  39.29 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  37.14 
 
 		 174 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  36.43 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  39.29 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  37.24 
 
 		 182 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  36.23 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  35 
 
 		 171 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  35.66 
 
 		 178 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  37.06 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  34.78 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  33.57 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  29.37 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  32.87 
 
 		 173 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  32.87 
 
 		 173 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  30.34 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  28.97 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  29.41 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  29.5 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  24.62 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  22.63 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  24.31 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  25.87 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  27.5 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>