63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0313 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  100 
 
 
169 aa  345  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  77.78 
 
 
171 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  56.55 
 
 
171 aa  183  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  48.75 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  48.75 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  46.45 
 
 
157 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  49.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  49.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  49.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  49.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  48.12 
 
 
171 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  50.34 
 
 
164 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  51.03 
 
 
174 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  45.81 
 
 
157 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  50.34 
 
 
161 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  52.41 
 
 
152 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  50.34 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  51.03 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  46.43 
 
 
198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  51.03 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  51.03 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  46.43 
 
 
166 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  46.48 
 
 
190 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  46.04 
 
 
158 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  36.26 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  34.69 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  37.14 
 
 
247 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  37.14 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  36.15 
 
 
264 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  30.13 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  34.81 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  31.08 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  36.3 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  29.57 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  33.08 
 
 
166 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  28.7 
 
 
204 aa  54.7  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  29.33 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  33.33 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  32.12 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  28.21 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  28.17 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  33.06 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  34.43 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  28.87 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.69 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  27.67 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  34.23 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  29.93 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  34.17 
 
 
173 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  26.01 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  27.22 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  30.4 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  26.72 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  24.16 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3556  hypothetical protein  28.19 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.217786  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  32.71 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0236  hypothetical protein  40.62 
 
 
60 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  29.09 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  31.15 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  25.2 
 
 
174 aa  40.8  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>