49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3290 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  333  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  70.62 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  48.5 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  45.62 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  52.23 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  46.06 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  44.65 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  48.75 
 
 		 171 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  50.32 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  45.51 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  40.4 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  40.4 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  40.91 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  38.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  37.66 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  38.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  44.23 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  40.52 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  35.95 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.01 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  35.58 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  38.67 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  38 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  35.06 
 
 		 164 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  33.79 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  31.41 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  28.39 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  28.39 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  28.39 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  28.93 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  28.21 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  28.39 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  28.39 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  28.48 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  28.39 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  27.85 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  30.4 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>