33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3596 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  33.55 
 
 
171 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  33.09 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  31.13 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  31.03 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  31.03 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  31.43 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  31.43 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  31.43 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  31.43 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  31.43 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  31.43 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  31.43 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  30.13 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  30.06 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  31.51 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  30.15 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  30.15 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  29.34 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  33.88 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  30.13 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  35.66 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  34.23 
 
 
166 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  31.97 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  32.17 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  32.21 
 
 
253 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  31.54 
 
 
247 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  34.29 
 
 
264 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  34.82 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3556  hypothetical protein  35.85 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.217786  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  29.23 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>