47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0560 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  95.38 
 
 		 173 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  95.38 
 
 		 173 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  71.68 
 
 		 173 aa  263  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  67.88 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  63.53 
 
 		 178 aa  231  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  41.86 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  46.36 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  36.25 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  37.66 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  36.84 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  36.9 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  34.81 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  31.29 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  30.06 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  29.45 
 
 		 204 aa  104  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.33 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  30.26 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  30.86 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  32.03 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  27.81 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  27.66 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  26.57 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  25.87 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  27.22 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  27.39 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  27.45 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  27.66 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  27.97 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  26.77 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  26.77 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  26.77 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  26.77 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  26.77 
 
 		 152 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  26.77 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  26.77 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  27.35 
 
 		 170 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  32.86 
 
 		 163 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  22.22 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  29.09 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>