47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2501 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  37.67 
 
 
161 aa  94.4  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  33.11 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  30.49 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  34.39 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  30.67 
 
 
165 aa  84.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  33.97 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  34.64 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  32.08 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  34.25 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  29.09 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  31.76 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  31.58 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  29.14 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.81 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  26.97 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  25 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  25 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  29.3 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  27.63 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  31.41 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.57 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  32.89 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  29.25 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 
198 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  27.5 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  29.93 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  29.93 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  32.06 
 
 
171 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  32.06 
 
 
171 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  29.93 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  29.93 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  29.93 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  32.06 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  29.87 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  26.06 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  25.62 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  25.62 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  25.62 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  26.42 
 
 
173 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  22.22 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>