55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0200 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  65.66 
 
 
174 aa  239  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  64.24 
 
 
174 aa  231  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  61.82 
 
 
166 aa  217  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  63.52 
 
 
171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  59.76 
 
 
171 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  62.11 
 
 
171 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  47.09 
 
 
173 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  48.5 
 
 
169 aa  158  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  43.31 
 
 
178 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  42.44 
 
 
173 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  42.44 
 
 
173 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  41.86 
 
 
173 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  42.68 
 
 
167 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  42.95 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  40.37 
 
 
164 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  42.38 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  42.24 
 
 
165 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  44.44 
 
 
168 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  41.61 
 
 
204 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  38.16 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  39.75 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  39.29 
 
 
147 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  31.58 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  31.3 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  30.37 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  30.37 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  30.37 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  31.11 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  30.37 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  30.37 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  30.37 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  30.37 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  31.88 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  31.88 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  30.07 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  31.88 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  28.19 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  29.77 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  28.12 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  32.5 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  32.23 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  32.5 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  32.5 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.71 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  34.23 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  26.35 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  25.47 
 
 
176 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  31.01 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  29.93 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  26.85 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>