27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2384 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  50.9 
 
 		 169 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  50.29 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  47.59 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  48.02 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  45.76 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  40.24 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  29.88 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  22.97 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  25.15 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  25.95 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  26.67 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  23.65 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  26.53 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  26.72 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  23.4 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  24.02 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  24.67 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  24.14 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  24.14 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  26.42 
 
 		 181 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  22.22 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>