60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1631 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  354  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  45.96 
 
 
182 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  46.06 
 
 
169 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  46.45 
 
 
166 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  44.3 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  42.86 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  42.38 
 
 
176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  41.52 
 
 
171 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  44.24 
 
 
171 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  46.36 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  42.31 
 
 
174 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  42 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  43.71 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  39.75 
 
 
165 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  37.65 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  44.37 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  44.37 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.88 
 
 
164 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  43.59 
 
 
167 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  42.38 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  38.89 
 
 
165 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  39.24 
 
 
161 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  36.6 
 
 
168 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  39.24 
 
 
164 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  32.43 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  29.71 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  32.89 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  34.81 
 
 
169 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  31.07 
 
 
164 aa  61.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  26.01 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  29.65 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  30.92 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  29.45 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  30.67 
 
 
152 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  30.26 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  28.47 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  29.08 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  29.61 
 
 
198 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  29.61 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  29.61 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  29.61 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  31.13 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  26.32 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  25.66 
 
 
157 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  27.7 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  25.15 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  30.71 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0309  hypothetical protein  31.93 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443313  normal  0.0752906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2847  hypothetical protein  24.29 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>