53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5049 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  34.44 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  34.64 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  32.03 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  31.33 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  30.41 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  31.51 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  29.73 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  30.67 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  28.85 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  33.79 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  30.67 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  28.1 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  28.77 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  32.43 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  30 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  29.58 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  27.78 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  27.7 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  26.25 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  29.09 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  25.9 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  27.27 
 
 
174 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  27.08 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  27.08 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  29.68 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.87 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  28.19 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  27.52 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  28.19 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  28.19 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  28.19 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  28.19 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  28.19 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  28.19 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  26.71 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  27.08 
 
 
174 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  27.08 
 
 
174 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  25.85 
 
 
198 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  24.31 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  24.31 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  29.93 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  29.73 
 
 
169 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  33.56 
 
 
163 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  32.17 
 
 
171 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  30.28 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  27.89 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  25.53 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>