52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0543 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  96.82 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  84.08 
 
 		 164 aa  283  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  76.43 
 
 		 171 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  76.25 
 
 		 174 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  76.25 
 
 		 174 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  76.25 
 
 		 161 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  74.38 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  75.64 
 
 		 171 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  74.38 
 
 		 174 aa  245  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  75.64 
 
 		 171 aa  245  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  75.64 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  75.64 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  75.64 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  75.64 
 
 		 158 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  73.12 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  75.84 
 
 		 174 aa  238  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  76 
 
 		 152 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  46.45 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  51.75 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  45.21 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  44.2 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  42.65 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  42.96 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  39.72 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  38.57 
 
 		 247 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  37.86 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  37.98 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  30.15 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  32.65 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  28.95 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  30.07 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28.28 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  30.52 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  29.41 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  30.53 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  30.08 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  27.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  31.68 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  25.83 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  25.66 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  24.31 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  26.12 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  22.56 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  22.39 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  30.69 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  30.97 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  29.7 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3556  hypothetical protein  29.68 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.217786  normal  0.844306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>