29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0877 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  71.26 
 
 		 166 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  54.94 
 
 		 158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  54.61 
 
 		 190 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  42.55 
 
 		 174 aa  97.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  39.26 
 
 		 198 aa  97.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  36.26 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  42.55 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  42.55 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  41.84 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  42.38 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  41.84 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  38.65 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  38.65 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  42.57 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  42.57 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  39.72 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  42.57 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  39.01 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  38.52 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  34.04 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  28.15 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  34.82 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1421  hypothetical protein  28.87 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  27.45 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>