54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6177 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  94.83 
 
 
174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  94.83 
 
 
174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  94.83 
 
 
174 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  93.68 
 
 
198 aa  337  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  94.41 
 
 
161 aa  314  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  93.79 
 
 
161 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  81.03 
 
 
171 aa  289  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  80.46 
 
 
171 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  80.46 
 
 
171 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  81.37 
 
 
158 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  81.37 
 
 
158 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  81.37 
 
 
158 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  81.37 
 
 
158 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  84 
 
 
152 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  78.12 
 
 
164 aa  256  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  74.38 
 
 
157 aa  245  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  74.38 
 
 
157 aa  245  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  51.03 
 
 
169 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  47.95 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  51.75 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  42.86 
 
 
190 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  44.1 
 
 
166 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  43.62 
 
 
158 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  34.04 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  42.55 
 
 
164 aa  97.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  38.57 
 
 
247 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  38.57 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  39.53 
 
 
264 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  29.34 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  30.26 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  33.81 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  31.88 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28.38 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  29.53 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  27.22 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  29.71 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  28.26 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  30.26 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  26.76 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  28.38 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  28.39 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.83 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  27.89 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  24.65 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  27.21 
 
 
204 aa  45.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  27.12 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.97 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  27.12 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  31.2 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  25.74 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>