54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2903 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 174 aa  356  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  94.83 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  94.25 
 
 		 198 aa  336  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  93.1 
 
 		 174 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  93.1 
 
 		 174 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  99.38 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  92.55 
 
 		 161 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  81.61 
 
 		 171 aa  290  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  81.03 
 
 		 171 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  81.03 
 
 		 171 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  81.99 
 
 		 158 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  81.99 
 
 		 158 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  81.99 
 
 		 158 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  81.99 
 
 		 158 aa  269  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  84.67 
 
 		 152 aa  266  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  77.5 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  76 
 
 		 157 aa  240  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  75.84 
 
 		 157 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  50.34 
 
 		 169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  44.74 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  47.26 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  51.41 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  45.1 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  44.3 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  34.06 
 
 		 142 aa  97.8  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  42.55 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  37.86 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  37.86 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  38.76 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  30.13 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  34.53 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  29.33 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  29.71 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  31.88 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28.38 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  28.06 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  29.53 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  29.65 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  26.06 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  28.67 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.83 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  28.39 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.39 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  26.75 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  26.75 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  29.91 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  26.58 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  25.53 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  29.06 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  32.73 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>