37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1244 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  100 
 
 		 166 aa  336  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  71.26 
 
 		 164 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  69.38 
 
 		 158 aa  213  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  57.83 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  46.43 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  44.1 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  45.1 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  44.44 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  45.1 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  46.1 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  46.48 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  46.48 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  46.48 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  46.48 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  46.36 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  46.36 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  46.36 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  46.36 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  46.36 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  46.36 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  47.48 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  42.96 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  44.53 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  42.96 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  45.77 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  34.56 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  34.23 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  33.57 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  28.99 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  32.86 
 
 		 247 aa  50.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  33.87 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  31.72 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  30.71 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  25.34 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  25.53 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  24.65 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>