56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3198 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  98.25 
 
 
171 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  99.34 
 
 
152 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  82.18 
 
 
174 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  82.18 
 
 
174 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  81.03 
 
 
174 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  80.46 
 
 
174 aa  283  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  79.31 
 
 
198 aa  278  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  81.99 
 
 
161 aa  270  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  83.23 
 
 
161 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  83.44 
 
 
164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  75.64 
 
 
157 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  75.64 
 
 
157 aa  245  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  48.75 
 
 
169 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  50.62 
 
 
171 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  45.4 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  46.36 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  43.66 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  47.1 
 
 
158 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  32.37 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  42.57 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  40.43 
 
 
253 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  39.72 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  40.31 
 
 
264 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  31.43 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  36.76 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  32 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  30.87 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  30.37 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  30.3 
 
 
179 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  30.94 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  29.5 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  28.38 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  30.43 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  28.19 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  31.36 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  25.69 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.86 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  32.06 
 
 
181 aa  48.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  25.47 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  28.03 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  28.21 
 
 
169 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  27.27 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  28.26 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  24.83 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0236  hypothetical protein  38.33 
 
 
60 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  26.77 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  25.98 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  25.98 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  26.09 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>