30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0136 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  93.28 
 
 
247 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  91.7 
 
 
264 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  40.43 
 
 
171 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  40.43 
 
 
171 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  40.43 
 
 
158 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  40.43 
 
 
158 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  40.43 
 
 
158 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  40.43 
 
 
158 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  41.18 
 
 
164 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  40.43 
 
 
152 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  40.43 
 
 
171 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  38.57 
 
 
174 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  38.57 
 
 
161 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  37.86 
 
 
157 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  37.86 
 
 
157 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  38.57 
 
 
174 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  38.57 
 
 
174 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  37.86 
 
 
161 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  37.86 
 
 
174 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  37.86 
 
 
198 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  37.14 
 
 
169 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  35.42 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  37.59 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  34 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  31.3 
 
 
142 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  32.21 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
158 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  33.57 
 
 
166 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  31.31 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>