37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3740 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  92.68 
 
 		 164 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  64.63 
 
 		 165 aa  220  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  73.47 
 
 		 147 aa  207  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  56.17 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  52.94 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  52.29 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  48.37 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  39.75 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  39.22 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  38.56 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  39.74 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  39.33 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  38.31 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  37.74 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  35.19 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  34.36 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  37.91 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  34.64 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  35.29 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  32.03 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  35.06 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  32.03 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  32.03 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  32.03 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  29.25 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  29.94 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  31.15 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  27.5 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  29.58 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  24.46 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  25.64 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  26.39 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  27.63 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>