38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3440 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3440  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3740  hypothetical protein  92.68 
 
 		 164 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  64.63 
 
 		 165 aa  219  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  72.79 
 
 		 147 aa  206  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3568  hypothetical protein  56.97 
 
 		 161 aa  173  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  54.25 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  53.59 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  50.33 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  40.37 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  41.94 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  39.88 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  41.33 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  39.87 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  38.31 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  37.04 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  36.2 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  37.25 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  37.25 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4248  hypothetical protein  34.64 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3290  hypothetical protein  37.01 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0117613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  32.68 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  31.33 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  32.68 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  32.68 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2501  integral membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  28.85 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  28.87 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  26.42 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  25.79 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  28.69 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  22.97 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  25.18 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  26.95 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  30.53 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  29.92 
 
 		 171 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0309  hypothetical protein  30.41 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443313  normal  0.0752906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>