25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2292 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  337  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  51.75 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  40.24 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  44.57 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  44.57 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  42.07 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  37.34 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0878  hypothetical protein  28.48 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  30.2 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  29.45 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  28.37 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.66 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  28.37 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  27.08 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  28.77 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  25.32 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  26.21 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  31.01 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  25.95 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  23.65 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  25.34 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5049  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  29.08 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  24.82 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4757  hypothetical protein  23.74 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>