29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1248 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.611123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0663  integral membrane protein-like protein  52.32 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2384  hypothetical protein  47.59 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0526  hypothetical protein  49.4 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1876  hypothetical protein  48.8 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1939  hypothetical protein  43.95 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341321  normal  0.0211682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2292  hypothetical protein  42.07 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3569  hypothetical protein  28.87 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.971012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1631  hypothetical protein  26.01 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0200  hypothetical protein  28.19 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0345  putative membrane protein of unknown function  27.11 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04018  hypothetical protein  30.18 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  32.12 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0438  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  28.22 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  27.56 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0161  hypothetical protein  26.62 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0204  hypothetical protein  25.95 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0165  hypothetical protein  25.49 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3107  hypothetical protein  24.86 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3844  hypothetical protein  22.3 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3374  hypothetical protein  24.84 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0158  hypothetical protein  24.84 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.570342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0175  hypothetical protein  23.68 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3485  hypothetical protein  26.53 
 
 		 173 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.183501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0585  hypothetical protein  26.09 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.294633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0560  putative membrane protein of unknown function  27.35 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.261245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0596  hypothetical protein  26.09 
 
 		 173 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.576542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  26.32 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>