More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1919 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04267  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  57.32 
 
 		 555 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3606  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.59 
 
 		 559 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 563 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 		 555 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 555 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 559 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1456  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.32 
 
 		 549 aa  844    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.504666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2392  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.86 
 
 		 551 aa  817    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.935698  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4602  ABC transporter, ATP-binding protein  56.99 
 
 		 563 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6251  putative ABC transporter ATP-binding protein  91.62 
 
 		 549 aa  1028    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.32 
 
 		 557 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 557 aa  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 554 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 553 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 554 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.27 
 
 		 547 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0959  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.67 
 
 		 549 aa  798    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.465393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3066  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.81 
 
 		 555 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00794174  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.97 
 
 		 595 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.72 
 
 		 558 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2485  putative ABC transporter ATP-binding protein  90.18 
 
 		 550 aa  1009    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.445071  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 		 557 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.12 
 
 		 557 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.88 
 
 		 554 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 		 551 aa  824    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.07 
 
 		 561 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 555 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 559 aa  691    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2460  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.65 
 
 		 559 aa  766    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.84 
 
 		 558 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.23 
 
 		 559 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 555 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.12 
 
 		 561 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 		 556 aa  717    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  70.93 
 
 		 551 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.6 
 
 		 554 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.11 
 
 		 559 aa  782    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 554 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.86 
 
 		 560 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 549 aa  1131    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 		 559 aa  705    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.58 
 
 		 551 aa  824    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.98 
 
 		 556 aa  701    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.71 
 
 		 553 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.44 
 
 		 553 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  91.26 
 
 		 549 aa  1014    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 553 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  98.54 
 
 		 549 aa  1119    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4627  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  90.36 
 
 		 550 aa  1009    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 553 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.61 
 
 		 579 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.81 
 
 		 589 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.97 
 
 		 555 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.97 
 
 		 670 aa  743    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 705 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2117  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.14 
 
 		 549 aa  866    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.129596  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.78 
 
 		 555 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2033  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.77 
 
 		 549 aa  857    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 556 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4990  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.66 
 
 		 551 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.83 
 
 		 556 aa  647    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0552  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1718  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.32 
 
 		 549 aa  843    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 560 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.98 
 
 		 555 aa  730    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0671  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 555 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  66.06 
 
 		 555 aa  757    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0421  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.61 
 
 		 554 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 555 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 555 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.84 
 
 		 561 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 		 560 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 556 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.32 
 
 		 559 aa  714    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1411  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.27 
 
 		 584 aa  840    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.13 
 
 		 551 aa  838    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.55 
 
 		 561 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.87 
 
 		 555 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3474  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.52 
 
 		 551 aa  885    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128055  normal  0.617651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.43 
 
 		 559 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.72 
 
 		 557 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.43 
 
 		 553 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.4 
 
 		 560 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 553 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 555 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>