264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3593 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  69.98 
 
 		 484 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  85.12 
 
 		 484 aa  818    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  70.19 
 
 		 484 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  98.76 
 
 		 484 aa  956    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  68.39 
 
 		 483 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  100 
 
 		 484 aa  969    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  87.4 
 
 		 484 aa  836    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  71.9 
 
 		 483 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  80.17 
 
 		 484 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  85.33 
 
 		 484 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  85.74 
 
 		 484 aa  823    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  70.19 
 
 		 484 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  69.98 
 
 		 484 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  80.58 
 
 		 484 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  70.19 
 
 		 484 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  84.5 
 
 		 484 aa  811    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  50.62 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  51.87 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.04 
 
 		 481 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  49.38 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  51.36 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  48.33 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  48.96 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.33 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  49.17 
 
 		 480 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  48.12 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  48.12 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  48.75 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.48 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  48.54 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.13 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  47.72 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  46.97 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  51.55 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  47.14 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  38.12 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  40.49 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  42.2 
 
 		 485 aa  362  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.78 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  37.71 
 
 		 482 aa  356  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  40 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  39.96 
 
 		 500 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.62 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  40.26 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  37.11 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.8 
 
 		 482 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.01 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.42 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.97 
 
 		 478 aa  296  5e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.64 
 
 		 483 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.46 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  34.58 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  34.58 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  38.12 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  35.45 
 
 		 482 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.43 
 
 		 479 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  37.39 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.78 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.85 
 
 		 484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.65 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.85 
 
 		 491 aa  283  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  34.84 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.44 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.31 
 
 		 488 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.29 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.44 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.77 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  36.01 
 
 		 483 aa  276  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.92 
 
 		 485 aa  276  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.09 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.03 
 
 		 483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  35.42 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.22 
 
 		 485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.95 
 
 		 498 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  42.26 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  36.02 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  40.99 
 
 		 484 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  35.46 
 
 		 479 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.61 
 
 		 498 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  35.02 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.04 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.93 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.51 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.82 
 
 		 481 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.11 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.28 
 
 		 482 aa  269  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.5 
 
 		 491 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  35.98 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.61 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  35.98 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.12 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.09 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.78 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.44 
 
 		 483 aa  266  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>