63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3304 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  91.7 
 
 		 663 aa  1214    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 663 aa  1335    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  53.17 
 
 		 662 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  53.42 
 
 		 664 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  53.02 
 
 		 662 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.78 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  22.24 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  20.63 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.31 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.08 
 
 		 510 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.96 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  24.46 
 
 		 763 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.9 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.55 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.9 
 
 		 741 aa  55.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  20.5 
 
 		 507 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.49 
 
 		 653 aa  54.3  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  19.43 
 
 		 790 aa  54.3  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  20.89 
 
 		 753 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  20.4 
 
 		 790 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  20.96 
 
 		 750 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.23 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.23 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.23 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  20 
 
 		 779 aa  51.6  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.5 
 
 		 499 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  30.94 
 
 		 741 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  20.68 
 
 		 518 aa  50.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  21.38 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  22.36 
 
 		 741 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.12 
 
 		 736 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.36 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  25.32 
 
 		 735 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  21.61 
 
 		 741 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  22.48 
 
 		 741 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 761 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.71 
 
 		 739 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.71 
 
 		 739 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  19.71 
 
 		 795 aa  47.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 222 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.71 
 
 		 739 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 222 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.71 
 
 		 739 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  22.15 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  21.96 
 
 		 532 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  22.93 
 
 		 505 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  20.66 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.1 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.15 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2022  chromosome partitioning ATPase  31.52 
 
 		 215 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.53 
 
 		 772 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.99 
 
 		 736 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.94 
 
 		 730 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  22.71 
 
 		 734 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  20.85 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3177  hypothetical protein  20 
 
 		 726 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 		 745 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  22.58 
 
 		 753 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.7 
 
 		 439 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  0.0655667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  21.33 
 
 		 746 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>